FBI Agent Fox Mulder und seine Kollegin Dana Scully sind von den X-Akten abgezogen worden und verrichten ihren Dienst als "normale" FBI-Agenten. Die beiden werden dann auch gleich bei einer Bombensuchaktion des FBI eingesetzt. Durch Zufall findet "Spooky" Mulder die Bombe, was jedoch nichts zur Sache tut, da der Einsatzleiter die Bombe wider Erwarten nicht zu entschärfen versucht. Mulder und Scully versuchen nun die mysteriösen Umstände zu klären, die zum Tod von 3 Feuerwehrleuten, des Einsatzleiters und eines kleinen Kindes führten. Schon bald merken die Agenten, dass die Vorfälle Teil eines viel größeren Puzzles sind, und dass irgendjemand gar nicht möchte, dass das Rätsel aufgeklärt wird…